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标题: 计算机辅助药物设计workshop [打印本页]

作者: FEinfo 时间: 2018-11-22 15:22
标题: 计算机辅助药物设计workshop
课程背景

随着近年来国内生物医药行业的蓬勃发展，加速药物分子的临床前筛选发现和优化已成为医药行业从业人员的普遍需求。多年来，计算机辅助药物设计（CADD）作为赋能医药企业药物研发，减少药物分子临床前研究时间和成本的重要手段已被很多国际大型医药公司广泛使用，这一手段也成为AI时代背景下相关从业人员的一项必备技能。清华大学药学院在结构生物学、化学、生物学等方面的突出优势，结合薛定谔在计算化学领域的领先成果，双方共同成立了计算药物化学卓越中心并设计开发了本课程，旨在培养计算机药物开发设计领域的领军人才。

课程软件

本次workshop使用的教学软件：薛定谔软件（ Schrödinger）作为行业内最富盛名且被普遍使用的一款药物发现软件，已被国际医药巨头公司如（Pfizer、MORPHIC、SANOFI等）使用多年，在学术界也得到了广泛认可，例如（Columbia University、Yale University、Harvard University、MIT、Stanford、UCSF）等都是该软件的客户群。

课程内容
本次workshop主要专注于小分子药物研发设计模块，让用户通过直观的药物模型模拟方法，专门解决与小分子药物设计相关的关键问题。
软件包含多种药物设计和筛选的模块：
1.受体-配体对接
2.诱导契合对接
3.药效团/形状筛选
4.三维定量构效关系

本次workshop的主要培训内容如下
1.Maestro 基本介绍：生物大分子可视化的操作及介绍
2.抗体建模：抗体药物的设计及建模
3.Glide虚拟筛选：基于对接的小分子药物虚拟筛选流程原理及应用
4.诱导契合对接：快速而精准的IFD方法原理及应用
5.药效团建模：基于Phase模块的药效团建模及其在LBDD和SBDD上的应用
6.Watermap原理及应用：基于Watermap进行小分子设计、靶点成药性评价
7.分子动力学模拟：基于Desmond模块的分子动力学模拟及其在药物设计中的应用
8.自由能微扰（FEP+）原理及应用：基于全新精准的分子力场OPLS3和增强采样方法REST的FEP+在多个体系下已经达到实验误差级的相对自由能预测，在先导化合物的活性优化，性质预测、骨架跃迁等方面已经在小分子药物设计优化方面产生了重要影响。

使用 Schrödinger制作的蛋白质的三维结构图
上课时间：2018年12月15-16日
上课地点：清华大学
汇款方式
账户名称：清华大学（400）
账号：0200004509089131550
开户行名称：工行北京分行海淀西区支行
汇款用途：（薛定谔二期 +学员姓名）

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